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Suivi des infections graves par l’analyse miniaturisée des biomarqueurs de l’inflammation
Cette thèse vous permettra d’intégrer un projet expérimental pour la mise au point d’un dispositif microfluidique dédié à l’analyse rapide de biomarqueurs protéiques qui caractérisent l’inflammation en réponse à une infection grave (sepsis). En parallèle vous utiliserez une méthode de référence des laboratoires de biologie hospitalière pour comparer d’un point vue analytique la méthode miniaturisée et celle qui est en court d’utilisation pour le diagnostic des patients. L’utilisation des systèmes microfluidiques a pour finalité la diminution de la consommation d’échantillon et la simplification des étapes de préparation. Le doctorant se concentrera premièrement sur le choix de la méthode de détection tout en explorant la possibilité de paralléliser les analyses sur des marqueurs multiples. Pour cela un travail sur la conception et la fabrication de puces microfluidiques nécessitera l’utilisation de la salle blanche du C2N. Ensuite la mise au point des méthodes se fera avec des standards pour optimiser les limites de détection et dans quantification avant de travailler sur des prélèvements de patients. Ce projet pluridisciplinaire sera mené au sein d’équipes de deux laboratoires aux compétences complémentaires en chimie analytique, physico-chimie (ICP), micro et nanofluidique (C2N). Un premier volet concernera la réalisation d’ensemble instrumental rapide et performant dédié à l’analyse dans des structures micro-fluidiques. Un deuxième volet concernera la comparaison exhaustive des différents paramètres analytiques entre la méthode de référence et l’analyse miniaturisée.
Mots-clés
Diagnostic hospitalier/ Protéines / Microfluidique / Performance analytique / Sepsis
Contexte de travail
Nous proposons un travail de doctorat (3 ans, inscription à l’école doctorale 2MIB de l’Université Paris-Saclay- spécialité physique ou chimie au choix) dans le cadre du programme IHU PROMETHEUS (Institut Hospitalo-Universitaire) sur le sepsis. Le financement complet de cette thèse vient de nous être attribué et votre candidature ne passera pas par un concours de l’école doctorale. La prise de fonction est fixée à la rentrée universitaire 2025 (septembre-octobre). Idéalement, vous êtes diplômé(e) d’un master de chimie analytique ou de microfluidique, ou de physico chimie, ou jeune ingénieur(e), et vous souhaitez intégrer deux laboratoires (ICP et C2N, associés au CNRS) de l’Université Paris-Saclay, pour travailler sur l’analyse de biomarqueurs (protéines) caractéristique de l’inflammation lors d’une infection grave. Vous avez une bonne connaissance en instrumentation, micro/nano-fluidique, traitement de données. Nous vous remercions de nous contacter rapidement en joignant un CV complet, vos relevés de notes des trois dernières années.