CNRS
Postée il y a 24 heures
Titre du projet : Cartographie de la base génomique de traits sexuellement antagonistes
Contexte : La sélection chez les mâles et les femelles est souvent antagoniste, car les caractères favorisés dans un sexe imposent souvent des coûts de fitness à l'autre, créant ainsi un conflit entre les sexes (Arnqvist et Rowe, 2005). Chez les patineuses d'eau douce, il existe un conflit concernant la fréquence des accouplements, de sorte qu'une fréquence élevée d'accouplements favorise les mâles, mais impose des coûts de fitness aux femelles (Arnqvist et Rowe, 2005). Cette sélection opposée entraîne souvent une escalade et une course aux armements entre les sexes, où les mâles développent des caractères qui augmentent la fréquence des accouplements et les femelles développent des caractères qui la réduisent (Arnqvist et Rowe, 2005 ; Crumiere et al., 2018 ; Crumiere et Khila, 2019). Ces phénotypes spécifiques à chaque sexe sont souvent appelés caractères sexuellement antagonistes. Bien que nous comprenions bien la coévolution antagoniste des sexes au niveau phénotypique, notre compréhension de la manière dont cette coévolution fonctionne au niveau génomique reste faible. Cela est principalement dû à la dichotomie entre les modèles où les études génétiques sont accessibles et ceux où nous comprenons le conflit sexuel.
Modèle d'étude : Ce projet tirera parti des patineuses d'eau comme modèles puissants pour l'étude du conflit sexuel, combinés aux outils génétiques et génomiques que nous avons récemment établis, pour identifier les loci sous-jacents à des caractères sexuellement antagonistes mâles et femelles. Nous nous concentrons sur un couple d'espèces appelé Gerris buenoi et Gerris odontogaster qui peuvent s'hybrider et dont les hybrides sont fertiles.
Les mâles de Gerris odontogaster possèdent des épines abdominales utilisées pour saisir les femelles (Arnqvist, 1989), tandis que ces épines sont absentes chez Gerris buenoi. Les femelles ont évolué une forme qui cache leur pièce génitale la rendant difficilement accessibles. Les hybrides possèdent des caractères antagonistes de taille intermédiaire. La possibilité de générer des hybrides et des croisements d'introgression représente un outil puissant pour étudier la base génomique des caractères sexuellement antagonistes et, par conséquent, la génomique du conflit sexuel.
Activités
- Réaliser des croisements génétiques sur 5 à 8 générations pour générer des hybrides. Ces croisements sont en cours et le chercheur rejoindra une équipe pour phénotyper, séquencer et cartographier les caractères mâles et femelles.
- Travail sur le terrain pour échantillonner de nombreuses populations de Gerris odontogaster à travers l'Europe. Ces populations seront phénotypées et séquencées pour associer la variation des caractères sexuellement antagonistes à la variation génétique.
- En collaboration avec des membres de l'équipe, le chercheur devra effectuer des évolutions expérimentales et utiliser des approches de rééchantillonnage et de séquençage pour suivre la fréquence des allèles sexuellement antagonistes.
Compétences
- Evolutionary biology with knowledge of sexual conflict
- Population genetics
- Bioinformatics
- Good communication and writing skills
- Motivation
Contexte de travail
L'IGFL est une unité de recherche dédiée à la science fondamentale où nous réalisons des recherches de découverte. Nous visons à comprendre le rôle du génome dans le développement, la fonction et l'évolution des organismes multicellulaires, avec un fort accent sur la recherche intégrative à l'échelle de l'organisme en utilisant une diversité d'organismes modèles et non-modèles.
L'unité est composée d'équipes de recherche partageant une vision commune de la science et un intérêt pour la biologie intégrative et multidisciplinaire. Nous formons une nouvelle génération de scientifiques et diffusons nos recherches auprès du grand public. Bien que notre recherche soit de nature fondamentale, nous souhaitons également continuer à traduire certains de nos résultats en potentiels atouts pour le secteur économique.
Nous développons une variété d'approches expérimentales (bioinformatique / biologie comparative / génétique / épigénétique / génomique / biochimie / imagerie / modélisation) soutenues par des scientifiques aux profils et expertises divers (généticiens, génomistes, biologistes du développement, biologistes cellulaires, biologistes moléculaires, biologistes évolutifs, paléobiologistes, physiologistes, biochimistes, biologistes computationnels, modélisateurs et bioinformaticiens). Cette diversité multidisciplinaire fait de l'IGFL un environnement de recherche unique et attractif pour le personnel à tous les niveaux, en provenance de France et de l'étranger.
Contraintes et risques
Certaines parties de ce projet nécessitent des visites le week-end au laboratoire pour s'occuper des animaux.